Raffai Jenő (aki évekig járt Hidas Györgyhöz tanulmányi analízisbe) egyik megfigyelése adta a kiindulópontot. Egy ifjúsági pszichiátriai osztályon skizofrén fiatalok pszichoterápiás gyógyításával kísérletezett, és azt tapasztalta, hogy a kezelés során olyan áttételi kapcsolat alakult ki közte és a páciens között, amelyben a páciensnek az volt az élménye, fantáziája, hogy a terapeutának a testében, méhében van. Az alapgondolat szerint, ha ez így van, akkor vissza kell menni a méhen belüli élethez, és ott lehet az eredeti kórokot megtalálni. Így jött az a gondolat, hogy megelőzés céljából a várandós anyák a születendő gyermekükkel együtt mentálhigiénés eszközökkel megközelíthetők, lehet segíteni kettejük kapcsolatát. Heidelbergben a Nemzetközi Pre- és Perinatális Pszichológiai és Orvostudományi Társaság XII. világkongresszusán 1995-ben tartották bemutatkozó előadásukat a magyar szakemberek Intrauterin anyareprezentáns címen, amely a kapcsolatanalízis mélylélektani elméletét alapozta meg.
A módszert az 1990-es évek közepén két magyar pszichoanalitikus dolgozta ki, dr. Hidas György (1925-2012) és tanítványa, dr. Raffai Jenő (1954-2015), a Magyar Pre- és Perinatális Pszichológiai Orvostudományi Társaság alapítói. Lelki köldökzsinór – Beszélgetések a kisbabámmal című közös munkájuk számos nyelven megjelent, s mélylélektani, kapcsolatfejlesztő módszerük nemzetközi sikereket ért el. 2004-től számos nagyvárosban oktatják, így Heidelbergben, Bécsben és Budapesten is.